Здание Шушинского филиала Национального музея ковра, построенное во второй половине XIX века, расположено в Верхнем квартале города. Так как во время оккупации здание пришло в негодность и его исторический облик был искажён, в 2021 году Фондом Гейдара Алиева здесь были начаты реставрационные работы.
Во время оккупации, учитывая угрозу, возникшую для произведений искусства, хранившихся в филиале, Азербайджанский национальный музей ковра организовал их эвакуацию 29 февраля 1992 года. Таким образом, из 246 экспонатов коллекции Шушинского филиала 183 были вывезены в Баку. Пока город находился под оккупацией, Шушинский филиал продолжал свою деятельность в составе Азербайджанского национального музея ковра. Сегодня здесь, наряду с ранее эвакуированными экспонатами, относящимися в основном к XVIII–XX векам, демонстрируются и ценные ковры, включённые в коллекцию филиала в последние годы. В музее вновь представлены в общей сложности 115 ворсовых и безворсовых ковров, изделия ковроткачества, археологические материалы, образцы национальной вышивки и одежды, ювелирные изделия и художественные металлические предметы.